質問者が納得iTunesライブラリの曲の保存先は外付けハードディスクですか？
iTunesは環境設定の「iTunes Mediaフォルダの場所」に指定されたフォルダに曲ファイルを保存します。
Windowsの場合、外付けハードディスクなどを抜き差しするとドライブレター（FとかGとか）が変わってしまいます。
ドライブレターが変わると住所が変わるようなものなので、iTunesは曲ファイルを見つけられなくなってしまい、曲に（！）を付けます。
データ用の外付けハードディスクはむやみに外さない方がよいです。
また、ドライブレター...
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