質問者が納得GPT保護パーティションとは
Win64やMacで使われるフォーマットで、Win32からは存在は確認できるがフォーマットや領域削除できないパーティーションです。
コマンドプロンプトから
DISKPARTコマンドで領域の削除が可能なようです。
ただし、間違えて他のディスクを削除しないよう注意して下さい。
こちらをご参考に
http://d.hatena.ne.jp/tera-p/20071111#p1
http://www.microsoft.com/japan/whdc/device/storage/G...
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