質問者が納得使用頻度にもよりますが､HDDの寿命は５年といわれてます｡
保存用として殆ど使わなかったのならもっともつでしょう。
しかし保存用ではなく､比較的頻繁に使ってきたなら５年だとそろそろ危ないです。
ましてや熱を持つのですから。もう今ご使用のHDDは保存用には使うのはやめたほうがいいです。
むしろ新たなHDDを保存用にして、今お使いのHDDをいつ壊れてもいい、
という前提でお使いになったほうがいいです。
熱が５０度近くになるなら、このHDD自体を使わず、２台買い換えることも検討してもいいでしょう。
補足
熱問題...
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