質問者が納得こんばんは。
>システム修復ディスクを作ればよいのですか?
そうです。CD-Rでないといけません。
システム修復ディスクは、OSが起動できなほどの
重大障害時にシステム修復ディスクでで起動して
外付けHDDに作成したシステムイメージから
修復する際に使用しますので、CDでなければなりません。
>安全な取り外しをしてからでUSBを いちいち抜いてOFFに
>しないといけないのでしょうか
そうです。出ないと画面上ではコピー作業が終わっていても
バックヤードで作業が続いている可能性があるからです。
以下を参考に...
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