質問者が納得iPhone内の音楽データを壊したくないということですよね？
音楽データは、バックアップに含まれません。
なので、iOSをアップグレードしたとして、
仮にデータが消えた場合は、バックアップから復元出来る内容に
音楽データがないので、消える可能性というのは少なからずあります。
また、同期とは、パソコンとiPhoneをお揃いにするものであり、
パソコン→iPhoneという一方通行でデータが流れる仕組みです。
なので、
現在の設定ならば、自動的に同期されることはないので
iPhoneの中は変更されません。
例...
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