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上の「GF-GTX650-E1GHD/GRN」の方がいいと思います。

大きさ的にも、しっぽ（ボードの後ろ部分）が短いので、そちらのマザーボードで物理的な干渉は無さそうです。
それら2つは性能敵に大きく変わるものではありませんが、GF-GTX650-E1GHD/GRNの方は補助電源ケーブルが不要な設計です。PCI Expressx16スロットに挿すだけで動作します。（そのスロットから電源をとります）

350Wの電源ですので、補助電源ケーブルは使わなくてよければ使わないに越したことはありません。
補助電源を使用するタイプの方が、ピーク（ブースト）時に最大出力＝性能が若干高くなりますが、電源の容量的な不安も無いこともありませんし、また、動画の編集やエンコードにはそれほどグラフィックボードの性能には比重が掛かりません。どちらかというと、CPUパワーの方を必要とします。エンコード作業は要は単純計算の繰り返しです。

依って、そちらの用途における実質的なパフォーマンスには変わりがないと思いますので、確実に電源の問題がないと思われる、無難なGF-GTX650-E1GHD/GRNの方をお勧めします。

グラフィックボードにはTDP（消費電力）が設定されていますが、ピーク時にはそれを超える電力が必要になることがあります。
補助電源のないタイプではPCI Expressスロットからのみの電力供給で動作しますが、これは約70Wまで、と決まりがあります。当然ですが、補助電源を必要としないボードではそれを超える電力を必要とするまでブーストしませんので、安全性は高いと言えます。