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データのバックアップソフトが着いているのと着いていない、という違いです。中身は一緒です。

「バッファローが無難」なんて言う店員はあまり信用できませんけどね。家電量販店の店員が言いそうです。
大容量を保存できない…云々はフォーマットし直せばいいんです。

HDDを選ぶ時は、まず用途により、回転数を調べます。動画を録画したり頻繁にデータを書き換えたりするのでしたら
回転速度が7200rpm以上が望ましいです。データのバックアップ用などでしたらそれ以下でも構いません。
※箱に書いてある転送速度云々はHDDの性能ではなく、接続ケーブルの違いですので関係ありません。
ここら辺をバッファローはさも高性能みたいな書き方をするから信用できないんですね。
どうせ中身は他のメーカーと同じOEM製品ですから。

あとは容量と接続ケーブルの形式(WinはほとんどUSB2.0かLANケーブル接続ですね)、ファンの有無、電源ユニットの大きさに
注意すればOKです。