質問者が納得普通の場合、NTFSでフォーマットされているUSB外付けHDDを同じWIN系でつなぎ替えてもフォルダやファイルは見れるのですが‥
一度外付けHDDのエラーチェックをしてみるのも良いでしょう。
http://windows.microsoft.com/ja-JP/windows7/Check-a-drive-for-errors
補足よんで
再起動し、最初の起動をGUIでなくDos画面で起動し下記を試してみては。
http://technet.microsoft.com/ja-jp/magazine/...
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