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プリインストールされて使わないアプリで、アンインストール可能なものは、全てアンインストールしましょう。
アプリケーションの管理で、アンインストールできます。

>それからアップデートのアンインストールとはなんなのでしょうか?
プリインストールされているアプリで、アンインストールできないアプリの場合、アップデートのアンインストールは出来ます。
例えば、YouTubeアプリはプリインストールされてアンインストールできないアプリですがアップデート分のアンインストールは可能です。
使うアプリであれば、最新版の方が良いと思いますが、使わないアプリをアップデートする必要はないので、アップデートのアンインストールを行いましょう。
こちらもアプリケーションの管理で、アップデートのアンインストールが可能です。

恐らくキャリアメール(@ezweb.ne.jp)を使用されていると思いますが、メールの保存先はSDではなく本体メモリです。
発売から2年くらい経過している端末なので、それなりに使用していれば、かなりの量のメールがあるはずです。
不要なメールを削除したり、メールのバックアップを行い、一度全てのメールを削除するのも良いと思います。