質問者が納得デュアルブートであれば起動時に OS の選択画面が出ると思いますので OS の選択画面が出ないのであればそれぞれの HDD を単独で接続して Windows をインストールしたと思われます。
この様に単独でインストールした場合は HDD の起動優先順位が高い HDD にインストールされている Windows から起動されます。
従って、BIOS の設定やケーブルの接続などで Windows 2000 がインストールされている HDD の起動優先順位を Windows 7 がインストールされている HDD...
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